Al inaugurarse el 19 de abril de 1904 el Consultorio Nacional de Enseñanza Dental, se contaba con una biblioteca integrada por 19 volúmenes. Los temas de estos libros eran principalmente referentes a las áreas médicas y odontológicas. También estaba incluido un volumen de la Constitución Mexicana y diccionarios inglés-español y francés-español. La presencia de los diccionarios se explica porque en ese tiempo casi todos los volúmenes estaban escritos en estos idiomas.
Es el 15 de marzo de 1958, cuando la Facultad de Odontología ocupa la nueva sede definitiva de sus instalaciones en Ciudad Universitaria y desde entonces se destina un local para la biblioteca situado en el 1er. Piso del edificio “C”.
En febrero de 1982 la Dirección General de Obras de la UNAM inicia las tareas de remodelación y ampliación de dicho local de biblioteca. En ese mismo año pero del mes de agosto fue reinaugurada la biblioteca, evento que estuvo acompañado con la exposición de acuarelas denominada: Paisaje Mexicano.
En 1991 es inaugurado por el entonces rector de la UNAM, Dr. José Sarukhán Kermez, un nuevo espacio para la biblioteca de más de 600 m2 en una parte del edificio “F” de la Facultad la cual lleva el nombre del profesor emérito Dr. Ignacio Aguilar Álvarez, ex director de la Facultad.
El 6 de julio de 2007 siendo director el Mtro. Javier de la Fuente Hernández dio inicio a los trabajos de ampliación y remodelación de la biblioteca en el edificio “F”, misma que contará con más de 1,300 m2 de construcción. Para que la biblioteca con sus fondos y capacidad de servicios reafirme su posición como punto de partida para apoyar cualquier proyecto de instrucción y modelos educativos del siglo XXI.
